En 1995, la zona donde se encuentra el Instituto Soka Amazonia fue acreditada por el Instituto Brasileño del Medio Ambiente y de los Recursos Naturales Renovables (IBAMA) como Reserva Privada del Patrimonio Natural (RPPN) Nazaré das Lajes y Lajes (Ordenanza Ministerial número 49, de junio de 1995).

En 1996, en un homenaje del Instituto Chico Mendes para la Conservación de la Biodiversidad (ICMBIO), la RPPN pasó a llamarse RPPN Dr. Daisaku Ikeda, como un tácito reconocimiento a los esfuerzos del fundador del Instituto por la preservación y la educación ambiental en la Amazonia.